Bio2Token：利用Mamba对任何生物分子结构进行全原子标记化

本研究解决了生物分子设计应用中，对大型3D分子结构进行高保真编码和表示的挑战。提出了一种量化自编码器，能够实现完整蛋白质、RNA和小分子结构的原子级标记，重建精度达到1埃以下。研究结果表明，Mamba状态空间模型在效率上优于其它方法，能够在更少的数据和计算资源下实现竞争性的精度，并且能够扩展到近10万个原子的系统。