使用R基础绘图系统进行绘图
内容提要
本文介绍R基础绘图系统，涵盖高层与低层函数，重点讲解plot()散点图、hist()直方图与密度曲线、barplot()条形图、pie()饼图、boxplot()箱线图与小提琴图、dotchart()克利夫兰点图，并说明通过pdf()、tiff()等函数导出图形的方法。
延伸解读
高层与低层函数的分工
R基础绘图系统将函数分为高层和低层两类。高层函数如plot()、hist()、boxplot()直接生成新图形；低层函数如points()、lines()、legend()则用于在已有图形上添加元素。这种分工让绘图像搭积木一样灵活：先用高层函数画出主体，再用低层函数逐步修饰，适合需要精细控制图形细节的场景。
直方图与密度曲线的配合要点
直方图受组距影响较大，需尝试不同breaks值。若要在直方图上叠加密度曲线，必须将hist()的freq参数设为FALSE，使纵轴为频率而非频数，否则密度曲线几乎不可见。此外，可用lines()添加密度线，用rug()添加轴须图展示数据分布趋势。
图形导出的两种方式与格式选择
导出图形可通过RStudio界面或代码。界面导出受窗口大小影响，不同尺寸会得到不同图形。推荐用代码方式：在pdf()、tiff()等设备函数和dev.off()之间放置绘图语句。格式选择上，bmp、png、jpeg为非矢量格式，易受分辨率影响但体积小，适合Word和PPT；ps为矢量格式，适合排版印刷；tiff支持多种色彩系统且跨平台，广泛用于出版物。
饼图的局限与替代方案
多数统计学家不推荐饼图，因为人眼判断长度比判断面积更准确，建议改用条形图或点图。基础包中pie()函数选项有限，但plotrix包提供了pie3D()和fan.plot()等扩展功能，可绘制三维饼图和扇形图，适合需要特殊展示效果的读者。
Q&A
R基础绘图系统包含哪些主要包？
R基础绘图系统主要由graphics和grDevices包组成，这两个包在R启动时会自动加载。
R基础绘图系统中的高层函数和低层函数有什么区别？
高层函数用于直接生成图形，如plot()、hist()、boxplot()、pairs()等；低层函数用于在已有图形上添加新元素，如points()、lines()、text()、title()、legend()、axis()等。
如何使用plot()函数绘制散点图并添加图例？
使用plot()函数绘制散点图，例如plot(dose, drugA)。要添加图例，可以使用legend()函数，如legend("topleft", title="Drug Type", legend=c("A","B"), lty=c(1,2), pch=c(15,17))。
如何绘制直方图并叠加密度曲线？
使用hist()函数绘制直方图，设置freq=FALSE以显示频率密度，然后使用lines(density(x))叠加密度曲线。例如：hist(Prewt, freq=FALSE, col="red")，lines(density(Prewt), col="blue", lwd=2)。
如何导出R图形为PDF或TIFF文件？
可以使用pdf()或tiff()等函数打开图形设备，绘制图形后调用dev.off()关闭设备。例如：pdf("mygraph.pdf")，boxplot(...)，dev.off()；或tiff(filename="mygraph.tiff", width=15, height=12, units="cm", res=300)，boxplot(...)，dev.off()。
箱线图和小提琴图分别用什么函数绘制？
箱线图使用boxplot()函数绘制，小提琴图使用vioplot包中的vioplot()函数绘制。
