上海交大余祥课题组发布可迁移深度学习模型,鉴定多类型 RNA 修饰、显著减少计算成本
原文中文,约4500字,阅读约需11分钟。发表于: 。同时,研究团队还通过 TandemMod 绘制了水稻幼苗在高盐胁迫下 m⁶A、m⁵C 和 Ψ 的表观修饰图谱,并揭示了 mRNA 中 m⁶A 和 m⁵C 的共修饰及其在高盐环境下的修饰率变化。同时,为解决体外合成序列转录的 RNA 无法覆盖自然序列全部范围的问题,研究团队对含有 T7 启动子的水稻 cDNA 文库进行体外转录,得到了具备不同修饰标签的数千个转录本,加 polyA 尾后通过...
上海交通大学研究团队开发了TandemMod深度学习模型,可直接在纳米孔中鉴定多种RNA修饰,减少数据量和训练时间,具有高准确性,适用于不同物种的DRS数据测序。