组织横截面和笔记标记的图像分割

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内容提要

我们开发了一个基于卷积神经网络的组织和笔迹分割模型,通过对200张H&E染色WSI数据集的训练,在组织分割和笔迹分割方面取得了较高的准确性。我们还提出了一种基于聚类的后处理方法,用于分离交叉部分,并证明该方法对于常见的玻片和扫描伪影具有鲁棒性。我们将经过训练的模型参数和后处理方法以SlideSegmenter的Python软件包公开发布。

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关键要点

  • 开发了基于卷积神经网络的组织和笔迹分割模型。
  • 通过对200张H&E染色WSI数据集的训练,取得了较高的准确性。
  • 提出了一种基于聚类的后处理方法,用于分离交叉部分。
  • 该后处理方法对常见的玻片和扫描伪影具有鲁棒性。
  • 将训练好的模型参数和后处理方法以SlideSegmenter的Python软件包公开发布。
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