从哈佛哲学系到蛋白质设计大师,David Baker:AlphaFold令我深刻认识到深度学习的力量
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原文中文,约8200字,阅读约需20分钟。
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内容提要
美国华盛顿大学的David Baker教授是蛋白质设计领域的顶尖专家,发表700余篇论文,并获得2024年诺贝尔化学奖。他创办了21家公司,推动蛋白质设计技术的产业化,开发了Rosetta和RoseTTAFold等重要工具,促进了科学研究与应用。
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关键要点
- David Baker教授是蛋白质设计领域的顶尖专家,发表700余篇论文,获得2024年诺贝尔化学奖。
- Baker创办了21家公司,推动蛋白质设计技术的产业化,开发了Rosetta和RoseTTAFold等重要工具。
- Baker于1962年出生在西雅图,最初对科学不感兴趣,后来因发育生物学课程而转向生物学。
- Baker在加州大学伯克利分校获得生物化学博士学位,随后在加州大学旧金山分校进行博士后研究。
- 1993年,Baker回到华盛顿大学,开始研发Rosetta软件,用于预测蛋白质结构。
- Rosetta于1998年发布,并在CASP竞赛中表现出色,成为蛋白质结构预测领域的领导者。
- Baker启动了Rosetta@home项目,利用全球闲置计算资源进行蛋白质结构计算。
- 2008年,Baker推出Foldit在线益智游戏,吸引了超过40万人参与,促进了科学研究。
- 2020年,AlphaFold2的出现对蛋白质结构预测产生了重大影响,Baker随后开发了RoseTTAFold作为开源替代品。
- Baker的团队还研发了RFdiffusion和ProteinMPNN等新技术,用于设计功能性新蛋白质。
- Baker通过成立公司推动技术落地,Xaira Therapeutics和Archon Biosciences等公司致力于新药物的开发。
- Baker的研究成果在学术界和工业界均取得了巨大突破,为人类生活带来了更多可能。
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