复旦脑科学研究院新成果:借鉴语义分割,开发空间转录组语义注释工具 Pianno
原文中文,约4900字,阅读约需12分钟。发表于: 。自 2020 年被 Nature Methods 评选为年度技术以来,简单来说,该技术能够获取组织空间信息和转录组数据,从时间和空间维度精准解析组织内基因表达模式,以及细胞类群的空间位置关系等生物学特征,在疾病研究、生长发育、器官结构和物种演化等领域的研究中均具有极高价值。随着空间转录组学在学术科研领域持续火爆,如 10x Visium、Slide-seq 以及 Stereo-seq...
复旦大学研究团队开发了Pianno工具,利用机器学习和计算机视觉技术自动注释空间转录组数据中的生物身份。Pianno在性能和准确性方面表现出色,并在不同数据集上进行了验证。该研究为空间转录组学研究提供了新的视角,有望推动生物学的发展。