利用 Transformer 和 RNN 在哺乳动物蛋白质中预测 O-GlcNA 修饰位点,使用新的损失函数训练

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内容提要

研究提出了一种新的分子性质预测方法SYN-FUSION,结合了图神经网络和Transformer的预训练特征,在MoleculeNet基准数据集上表现出卓越性能,优于以前的模型。与其他Graph-Transformer模型相比,性能相当。消融实验验证了SYN-FUSION的有效性,对预测分子性质有实质性改进。

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关键要点

  • 提出了一种新的分子性质预测方法SYN-FUSION。

  • SYN-FUSION结合了图神经网络和Transformer的预训练特征。

  • 在MoleculeNet基准数据集上表现出卓越性能,优于以前的模型。

  • 在5个分类数据集和6个回归数据集中具有优势。

  • 与其他Graph-Transformer模型相比,性能相当。

  • 消融实验验证了SYN-FUSION的有效性。

  • SYN-FUSION的协同效应超过了其各个模型组成部分。

  • 在预测分子性质方面有实质性的改进。

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