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内容提要
介绍了基于JSmol的在线服务MolCalc,可在浏览器中编辑3D分子结构并调用GAMESS进行简单的量子化学计算。用户可通过右键点击画图区域,在弹出的菜单里选择Console,然后输入write mol1.sdf或其他格式的文件来保存结构。同时介绍了DIY molecules服务,可将分子平面2D结构转换为3D结构。
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关键要点
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计算化学研究需要绘制和构建分子结构,3D结构比2D结构更直观。
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流行的3D分子结构构建程序包括GaussView、IQmol、Avogadro和PyMOL。
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MolCalc是一个基于JSmol的在线服务,可以在浏览器中编辑3D分子结构。
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MolCalc由哥本哈根大学的Jan H. Jensen课题组研发,支持调用GAMESS进行量子化学计算。
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用户可以通过右键点击画图区域,选择Console并输入命令保存分子结构。
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MolCalc允许用户搭建自己的服务,相关信息可在其GitHub仓库找到。
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DIY molecules服务可以将分子平面2D结构转换为3D结构。
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