潜在空间扩散的区分性蛋白质序列建模

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内容提要

本研究提出了一种结合自编码器与去噪扩散模型的蛋白质序列表示学习框架,旨在解决流形学习与分布建模的任务分解问题。实验结果表明,该模型的区分能力优于基线模型。

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关键要点

  • 本研究提出了一种结合自编码器与去噪扩散模型的蛋白质序列表示学习框架。
  • 该框架旨在解决流形学习与分布建模之间的任务分解问题。
  • 实验结果显示,该模型的区分能力优于基线模型。
  • 所提变体训练的扩散模型在潜在空间中运行,显示出更高的区分能力。
  • 尽管如此,这些扩散表示未能达到掩码语言模型嵌入的性能水平。
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