基于 AWS Step Functions 和 AWS Batch 服务构建宏基因分析工作负载
原文中文,约5000字,阅读约需12分钟。发表于: 。本文旨在介绍一个在 AWS 上构建宏基因分析工作负载的方案,该方案对常用的一些宏基因分析软件完成了容器化,并以批量计算服务 AWS Batch 为核心,构建容器化的宏基因分析集群和自动化工作流。本方案已经在多个客户的实际宏基因分析业务中得到应用,如土壤微生物/病毒宏基因分析,海洋微生物宏基因分析等。根据客户的实际业务场景,本方案也可以扩展到通用的基因分析场景。
本文介绍了在AWS上构建宏基因分析工作负载的方案,使用AWS Batch构建容器化的宏基因分析集群和自动化工作流,适用于大规模批量任务分析和自动化流程。方案部署使用CDK进行安装和配置,提供了完整的Workshop和参考文档。