摘星座：通过分层粗化的 SO (3) 等变自编码器实现蛋白质结构的可扩展建模
原文中文，约500字，阅读约需2分钟。发表于：。通过引入 Ophiuchus，一种 SO（3）- 等变粗粒化模型，我们在所有标准蛋白质残基的重原子上高效地操作，同时尊重其相关的对称性，从而缩小这个差距，并采用局部卷积粗化模型来模拟序列模体间的相互作用。我们训练 Ophiuchus 来重建 PDB 单体的连续片段，研究其在不同压缩率下的重建能力，并检查学习到的潜在空间，演示其在构象内插中的快速应用，并将插值轨迹与 PDBFlex...
本文介绍了一种名为SO3krates的Transformer架构，它结合了稀疏的等变表示和能够分离不变和等变信息的self-attention机制，从而消除了昂贵的张量积的需要。SO3krates实现了准确性、稳定性和速度的独特结合，使得我们能够在前所未有的时间和系统尺度上对物质的量子性质进行深入分析。
