TouchUp-G: 通过图层重心微调改善特征表示

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内容提要

本文提出了一种使用自监督和无监督学习相结合的方法创造新的边特征的框架,并结合基于 Popular GNN 架构提取的节点特征,用于节点分类。该方法在三个生物数据集上验证,对基线 Graph Attention Network (GAT) 和 Graph Convolutional Network (GCN) 模型有更好的效果,并且能够解释决定 COVID-19 的过程和严重程度的细胞类型和基因,为潜在疾病生物标记物和治疗靶点的不断发现做出贡献。

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关键要点

  • 提出了一种结合自监督和无监督学习的方法来创造新的边特征框架。
  • 该方法结合了基于 Popular GNN 架构提取的节点特征。
  • 通过端到端的训练方案用于节点分类。
  • 在三个生物数据集上验证了该方法的有效性。
  • 该方法在基线 GAT 和 GCN 模型上表现更好。
  • 能够解释决定 COVID-19 的过程和严重程度的细胞类型和基因。
  • 为潜在疾病生物标记物和治疗靶点的发现做出贡献。
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