基于 NONMEM、PsN 和 Amazon ParallelCluster 服务构建云端药代动力学/药效学建模及数据分析流程
原文中文,约14200字,阅读约需34分钟。发表于: 。本文以行业最常用的软件组合 NONMEM 和 PsN 作为 PK/PD 建模分析的核心,通过 Slurm 调度程序提交并分发作业至由亚马逊云科技 Amazon ParallelCluster 构建的计算集群之上,并借助并行计算框架 MPICH 提升计算效率。
定量药理学是使用数学、计算机和统计学等工具来描述药物在体内吸收、分布、代谢和排泄等过程的学科。定量药理学研究的目的是客观描述和定量评价药物在生物体内的疗效及毒副作用,预测药物在不同人群中的药代动力学和药效动力学变异性,为开发新药和优化临床使用药物提供定量依据。定量药理学离不开数学建模与模拟技术,例如PK/PD模型用于描述药物在体内的动态过程和药效学效应。NONMEM和PsN是定量药理学研究中常用的软件工具,Amazon ParallelCluster是一个用于部署和管理高性能计算集群的工具。本文介绍了NONMEM、PsN和Amazon ParallelCluster的安装和使用方法,并提供了一些作业调度的示例。