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原文英文,约800词,阅读约需3分钟。
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内容提要
R语言在生物信息学中应用广泛,可在Jupyter Notebook中运行。本文介绍如何在Windows、MacOS和Linux上设置R环境:用Conda创建环境,安装ipykernel和jupyter,再安装R和r-irkernel。最后,在Jupyter Notebook中选择R即可使用。
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关键要点
- R语言在生物信息学中应用广泛,可以在Jupyter Notebook中运行。
- 需要安装R编译器和R Studio,也可以直接在Jupyter Notebook中运行R代码。
- 本文介绍如何在Windows、MacOS和Linux上设置R环境。
- 使用Conda创建环境,推荐使用Miniconda。
- 创建新的Conda环境命令为:conda create --name r-conda。
- 激活Conda环境命令为:conda activate r-conda。
- 安装ipykernel和jupyter命令为:conda install ipykernel jupyter。
- 在Conda环境中安装R的命令为:conda install -c r r-irkernel。
- 打开Jupyter Notebook可以使用命令:jupyter notebook。
- 在Jupyter Notebook中可以直接选择R语言进行编程。
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