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如何在本地Jupyter Notebook中直接运行R程序
内容提要
R语言在生物信息学中应用广泛，可在Jupyter Notebook中运行。本文介绍如何在Windows、MacOS和Linux上设置R环境：用Conda创建环境，安装ipykernel和jupyter，再安装R和r-irkernel。最后，在Jupyter Notebook中选择R即可使用。
关键要点
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R语言在生物信息学中应用广泛，可以在Jupyter Notebook中运行。
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需要安装R编译器和R Studio，也可以直接在Jupyter Notebook中运行R代码。
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本文介绍如何在Windows、MacOS和Linux上设置R环境。
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使用Conda创建环境，推荐使用Miniconda。
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创建新的Conda环境命令为：conda create --name r-conda。
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激活Conda环境命令为：conda activate r-conda。
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安装ipykernel和jupyter命令为：conda install ipykernel jupyter。
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在Conda环境中安装R的命令为：conda install -c r r-irkernel。
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打开Jupyter Notebook可以使用命令：jupyter notebook。
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在Jupyter Notebook中可以直接选择R语言进行编程。
延伸问答
如何在Jupyter Notebook中运行R语言？
在Jupyter Notebook中运行R语言需要安装R编译器和R Studio，或直接在Notebook中运行R代码。首先设置Conda环境，然后安装ipykernel和jupyter，最后安装R和r-irkernel。
在Windows上如何设置R的Conda环境？
在Windows上设置R的Conda环境，首先安装Miniconda，然后使用命令创建新环境：conda create --name r-conda，接着激活环境：conda activate r-conda，最后安装ipykernel、jupyter和R。
使用Conda创建R环境的命令是什么？
使用Conda创建R环境的命令是：conda create --name r-conda。
如何在Jupyter Notebook中选择R语言？
在Jupyter Notebook中选择R语言时，创建新笔记本时会在“New”菜单中看到R选项，选择即可开始使用R语言。
安装ipykernel和jupyter的命令是什么？
安装ipykernel和jupyter的命令是：conda install ipykernel jupyter。
在Linux上如何安装R以在Jupyter Notebook中使用？
在Linux上安装R以在Jupyter Notebook中使用的步骤与其他操作系统相同，首先创建Conda环境，然后安装ipykernel、jupyter和R。
