本研究提出MeToken模型，解决了后翻译修饰（PTM）预测中对蛋白质序列的过度依赖问题。该模型通过令牌化氨基酸微环境，综合考虑序列与结构信息，显著提高了PTM类型的识别准确性，为蛋白质组学研究提供了新方法。