本研究提出MeToken模型，解决了后翻译修饰（PTM）预测中对蛋白质序列过度依赖的问题。该模型通过氨基酸微环境的令牌化，综合考虑序列和结构信息，显著提高了PTM类型识别的准确性，为蛋白质组学研究提供了新思路。