法国巴斯德研究所开发了三种深度学习模型,成功预测细菌的抗噬菌体功能。研究表明,细菌基因组中约1.5%的基因参与抗病毒防御,239万个抗噬菌体蛋白中85%未与免疫功能关联。这些发现揭示了细菌免疫系统的复杂性,推动了抗噬菌体机制的深入研究。
北京理工大学邵斌教授团队在《Nature Communications》上发表研究,推出首个生成式DNA大语言模型megaDNA,该模型能够生成长达10万碱基对的噬菌体基因组片段,并预测必需基因,具有重要的学术和应用价值。
研究揭示了反向转录酶在细菌中防御噬菌体的机制。T5噬菌体感染会触发长重复DNA的产生,该DNA以非编码RNA为模板,形成有毒蛋白,抑制病毒传播。通过纯化反向转录酶-非编码RNA复合物,研究确定了其反向转录和重复合成活性,并通过冷冻电子显微镜展示了其结构。
研究揭示了反向转录酶在细菌中对抗T5噬菌体的机制。T5噬菌体感染会引发长重复DNA的产生,这些DNA以非编码RNA为模板,形成有毒重复蛋白,抑制病毒传播。通过纯化反向转录酶-非编码RNA复合物,研究展示了其反向转录和重复合成的活性,并通过冷冻电子显微镜确定了其结构。
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