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本文提出了一种基于多模态注意力神经网络(PaccMann)预测抗癌化合物敏感性的方法,通过集成化合物的分子结构、癌细胞的转录组文件和细胞内蛋白质相互作用的先前知识,使用SMILES编码的化合物和癌细胞的基因表达谱预测IC50敏感性值。通过比较模型和基准模型,证明了使用注意力编码器可以超越基准模型,增强了可解释性并识别网络用于预测的基因、键和原子。

ACP-ESM:一种基于蛋白定向变压器方法的抗癌肽分类的新型框架

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2024-01-04T00:00:00Z

该文介绍了一种基于多模态注意力神经网络的方法,用于预测抗癌化合物的敏感性。该方法集成了化合物的分子结构、癌细胞的转录组文件以及关于细胞内蛋白质相互作用的先前知识,通过用 SMILES 编码的化合物和癌细胞的基因表达谱预测 IC50 敏感性值。使用注意力编码机制编码基因表达谱,证明了该方法可以超越基准模型,增强了可解释性并使我们能够识别网络用于进行预测的基因、键和原子。

高效融合词嵌入和深度学习技术用于抗癌肽分类:FastText+BiLSTM

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2023-09-21T00:00:00Z
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