百度飞桨和百图生科联合研发的HelixFold-Single模型是全球首个开源、无需MSA输入的蛋白结构预测大模型，实现了秒级别预测，速度平均提高数百倍。该模型在多肽、抗体、纳米抗体等高可变蛋白场景上效果优于AlphaFold2。同时，HelixFold-Multimer模型在抗原抗体、多肽蛋白的相互作用场景上精度提升数倍，达到当前业界SOTA。这些模型已成功应用于多肽药物设计系统，帮助发现新颖性和高潜力的候选多肽药物分子。