MIT团队开发了名为PottsMPNN的机器学习框架，用于改进计算蛋白质设计。该框架结合物理原理，能更准确建模序列-能量关系，生成结构可行但序列新颖的蛋白质，避免过度模仿天然序列。研究强调，传统以复现天然序列为成功标准并不最佳，PottsMPNN通过引入成对氨基酸相互作用和进化信息，提升了结构兼容性和突变稳定性预测，为设计新型蛋白质奠定基础。