可编程生物学旨在理性设计生命系统，超越传统研发限制。EDEN模型通过学习自然进化数据，提炼生物设计原则，推动生物工程进入可预测编程阶段。该模型在基因治疗和抗菌肽设计等领域展现出强大能力，验证了其作为统一生物设计引擎的潜力。

浙江大学和南方医科大学的研究团队开发了AMP-Designer，利用大型语言模型（LLM）在48天内设计出有效的抗菌肽（AMP），成功率高达94.4%。该方法结合先进的机器学习技术，针对抗生素耐药性问题，展示了在特定细菌上设计AMP的潜力。

世界卫生组织预测，到2050年，抗生素耐药性感染将导致每年1000万人死亡。山东大学研究团队结合潜在扩散模型与分子动力学，成功设计出多样性高的抗菌肽（AMPs），实验表明其对耐药性真菌有效，未来可拓展至其他功能性肽的设计。