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本研究开发了一种基于流动的生成建模方法,用于学习和采样蛋白质的构象空间。通过改进AlphaFold和ESMFold等预测器,获得了名为AlphaFlow和ESMFlow的蛋白质结构的序列有条件的生成模型。该方法在PDB上训练和评估时,在精确性和多样性方面优于具有MSA子采样的AlphaFold。经过全原子MD集合的训练后,该方法能够准确捕捉未知蛋白质的构象灵活性和位置分布。此外,该方法可以使静态PDB结构多样化,并具有更快的收敛时间,展示了其作为基于物理的仿真的替代品的潜力。

AlphaFold 与流匹配相遇:生成蛋白质合集

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2024-02-07T00:00:00Z
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