在MATLAB中配置模糊推理系统（FIS）时，首先定义输入及其隶属函数，然后定义输出及其隶属函数。为每个输出在规则中指定，确保语法正确，最后将规则添加到FIS中。确保所有输出隶属函数配置无误，并在修改后模拟FIS以验证其行为。