通过评估分子与已知活性化合物的相似性，提出了一个综合评估框架来解决结构基药物设计在实际应用中的限制。研究结果显示，当前的结构基药物设计模型在评分上表现出色，但在实际可用性指标上存在不足。提出的指标和数据集旨在填补理论预测与实际应用之间的差距，提高未来结构基药物设计模型的实际适用性。