Pairtools是一个处理配对末端测序数据的Python包，安装可能因依赖问题而复杂。本文提供详细的安装步骤，包括在GitHub Codespaces中创建干净环境、安装系统依赖、构建pysam以及在无构建隔离模式下安装pairtools，以解决链接问题并确保正常运行。