计算建模在生物学，特别是细胞信号转导研究中日益重要。加州大学与挪威实验室的研究团队提出了反应和传输空间建模算法（SMART），解决了多隔室时空模型问题。该算法有效捕捉细胞内空间效应，提升模型预测能力，为生物物理学模拟开辟新机遇。
本文综述了利用深度学习模型分析蛋白质相互作用的方法，包括基于生物物理学知识的模型、表示学习、几何深度学习和生成模型。同时，文章指出了该领域面临的挑战和新的研究方向。
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