杜克大学和西湖大学的研究人员开发了PTM-Mamba,这是一种能够同时建模野生型和翻译后修饰(PTM)序列的蛋白质语言模型。该模型通过双向Mamba块和新门控机制,增强了对PTM的理解,支持疾病关联和药物可药性预测等任务。研究表明,PTM-Mamba在多个基准测试中优于现有模型,展示了其在生物学研究和精准治疗中的潜力。
本研究提出了一种新方法,利用全基因组测序数据和参考代谢物,通过多视图变分自编码器对未知代谢物进行插补,效果优于传统技术,提升数据完整性,促进代谢途径与疾病关联研究。
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