量子程序中的两比特操作受限于物理量子比特的连通性。若比特未直接相连，编译器需插入SWAP门来路由，这会增加电路深度和错误率。IBM的Heron和Nighthawk处理器通过不同拓扑优化连通性，而ZuriQ的可重构离子阱架构则动态调整离子位置。连通性影响算法选择、错误纠正和计算能力，是量子计算扩展的关键。