本文提出了HGRL-DTA、GDGRU-DTA和GraphCL-DTA等新方法,用于药物靶标亲和力预测。这些方法结合深度学习和图表示学习技术,显著提高了预测准确性和模型泛化能力,为药物设计和发现提供了有效工具。
通过使用Shapley值以识别证据在最终预测中的相对重要性,Retrieve to Explain(R2E)解决了机器学习模型特别是语言模型在解释性上的困难,并在从科学文献中识别药物靶标的实用案例上展现了其优越性。
该研究评估了药物靶标相互作用预测方法的泛化性和性能夸大问题,并提出了一种新的负边缘子采样策略。通过体外验证,证明了新发现的相互作用的真实性。该研究为未来的基准测试和模型设计提供了基础。
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