Ophiuchus模型通过SO（3）-等变粗粒化方法高效处理蛋白质残基的重原子，保持对称性。模型使用局部卷积模拟序列模体间的相互作用。通过训练重建PDB片段，研究不同压缩率下的重建能力，并在构象内插中快速应用。利用去噪扩散概率模型采样小型蛋白质的潜在嵌入，实验显示Ophiuchus在蛋白质建模和生成中具备扩展性和效率。

本研究提出了DPLM-2模型，增强了蛋白质序列与结构关系的捕捉能力。DPLM-2是一种多模态模型，能同时学习和生成蛋白质的序列和三维结构。实验表明，该模型在生成任务中表现出色，提高了效率和兼容性。