MMDesign是一种新型蛋白质设计范式，利用自编码器语言模型将蛋白质序列的语义知识纳入其中，并引入了跨层跨模态对齐算法。实验结果表明，MMDesign在各种测试集上优于其他方法，并提出了定量分析技术来评估生成的蛋白质序列和数据分布的生物可能性。