研究发现,绿原酸与牛磺酸联合处理皮肤细胞能显著调控62个衰老相关基因,关键转录因子TGFB2、ETS1和EGR1在抗衰老中发挥重要作用。联合处理效果优于单独使用,可能通过改善细胞氧气利用来对抗衰老。尽管存在体外实验和样本量小的局限性,但为天然成分的抗衰老机制提供了新思路。
真核生物的RNA聚合酶、启动子、通用转录因子、转录激活因子及染色质结构对转录过程的影响是研究的关键内容。
研究团队提出了转录因子结合单元(TFBU)概念,利用深度学习量化转录因子结合位点(TFBS)周围序列的影响,开发了增强子设计工具DeepTFBU。研究表明,设计TFBS上下文序列能显著调节增强子活性,提升细胞类型特异性反应,为基因调控提供了新思路。
本研究提出了TFBS-Finder模型,结合预训练的DNABERT和卷积网络模块,提高了转录因子结合位点的预测准确性,促进了基因调控网络的理解。
哥伦比亚大学研究人员开发的GET模型揭示了213种人类细胞类型的转录调控机制。该模型结合染色质可及性数据和基因组序列信息,能够准确预测基因表达,并在识别转录因子相互作用方面表现出色,推动生物学研究向预测性转变。未来可整合更多生物信息,以深化对基因调控的理解。
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