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AI驱动的自主酶工程平台,底物偏好提升90倍,伊利诺伊大学新研究登Nature子刊

机器之心
机器之心 · 2025-07-16T06:07:44Z
Science新登,David Baker团队用AI从头设计栩栩如生的酶,比同类设计好6万倍

华盛顿大学研究团队利用人工智能RFdiffusion和深度学习网络PLACER,从头设计出高效丝氨酸水解酶,催化效率达到2.2x10^5 M^−1 s^−1。这一突破克服了传统设计的局限,标志着酶工程的重要进展,可能推动生物和工业应用的发展。

Science新登,David Baker团队用AI从头设计栩栩如生的酶,比同类设计好6万倍

机器之心
机器之心 · 2025-02-14T08:43:54Z
活性提高42倍,ML引导的无细胞表达加速酶工程,登Nature子刊

酶是重要的天然催化剂。斯坦福大学和西北大学的研究团队利用机器学习平台评估了1217种酶变体,成功提高了酰胺合成酶的活性,实验可在几天内完成,推动可持续生物制造的发展。

活性提高42倍,ML引导的无细胞表达加速酶工程,登Nature子刊

机器之心
机器之心 · 2025-01-24T06:55:00Z
准确预测蛋白质功能,中山大学基于几何图学习的酶工程新方法

中山大学团队开发了GraphEC,这是一种基于几何图学习的酶功能预测技术。它利用ESMFold预测结构和预训练的蛋白质语言模型,从蛋白质结构中提取功能信息。GraphEC能有效预测酶的活性位点、EC编号和最佳pH值,表现优于现有方法,具有在合成生物学和基因组学中的应用潜力。未来可通过改进结构质量和结合大型语言模型提升预测能力。

准确预测蛋白质功能,中山大学基于几何图学习的酶工程新方法

机器之心
机器之心 · 2024-10-17T03:52:00Z

本研究提出了EnzymeFlow模型,结合流匹配和共进化原理,克服了传统酶功能预测的局限性。该模型能够动态生成特定底物和反应的酶催化口袋,实验证明其在酶工程和合成生物学中的有效性。

EnzymeFlow: Dynamically Generating Reaction-specific Enzyme Catalytic Pockets through Flow Matching and Co-evolution

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2024-10-01T00:00:00Z
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