在项目中，JDK动态代理和基于反射的AOP导致了异常处理问题，预期的SpecialException被包装为UndeclaredThrowableException，影响业务逻辑。解决方案包括手动解包异常和使方法兼容所有异常，以确保正确传播。理解Java代理和Spring AOP的内部机制有助于避免此类问题。