在线教程丨David Baker团队开源RFdiffusion3,实现全原子蛋白质设计的生成式突破
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内容提要
目前包括 RFdiffusion(RFD1)和 BindCraft 在内的大多数方法,均采用氨基酸残基水平的蛋白质表示,已能够成功设计蛋白质单体、组装体以及蛋白质-蛋白质相互作用体系,但其分辨率仍不足以精确设计与非蛋白质组分(如小分子配体与核酸)发生特异性侧链相互作用的结构。研究团队通过设计并实验表征 DNA 结合蛋白与半胱氨酸水解酶,展示了 RFD3...
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