BEND:对 DNA 语言模型在有生物学意义的任务上进行基准测试

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内容提要

此研究提出了一种基于统计方法的BPE算法,用于替换基因组语言的k-mer标记。引入了高效的基因组基础模型DNABERT-2和全面的多物种基因组分类数据集GUE。该模型具有可比较的性能,参数和GPU时间用于预训练较少。

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