分子联合自编码:2D 和 3D 扩散下的轨迹预训练

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内容提要

该研究提出了一种面向分子联合自编码(MoleculeJAE)的预训练方法,能够学习分子的二维键和三维构象信息。MoleculeJAE通过扩增轨迹的弥散过程模型,以自我监督的方式学习分子的化学结构。在20个任务中,有15个任务达到了最先进的性能水平。

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关键要点

  • 该研究提出了一种面向分子联合自编码(MoleculeJAE)的预训练方法。
  • MoleculeJAE能够学习分子的二维键和三维构象信息。
  • 该方法通过扩增轨迹的弥散过程模型进行自我监督学习。
  • MoleculeJAE在12个竞争基准中表现优于对手。
  • 在20个任务中,有15个任务达到了最先进的性能水平。
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