该研究提出了一种面向分子联合自编码（MoleculeJAE）的预训练方法，能够学习分子的二维键和三维构象信息。MoleculeJAE通过扩增轨迹的弥散过程模型，以自我监督的方式学习分子的化学结构。在20个任务中，有15个任务达到了最先进的性能水平。