登 Cell 子刊!清华大学张强锋课题组开发 SPACE 算法,组织模块发现能力领先同类工具
原文中文,约7500字,阅读约需18分钟。发表于: 。SPACE 使用图自编码器 (Graph autoencoder) 框架来学习低维的细胞嵌入,该细胞嵌入描述了空间转录组数据中每个细胞自身的基因表达信息以及其与空间邻近细胞的相互作用信息(因此称该细胞嵌入为细胞-细胞相互作用感知的细胞嵌入,cell-cell interaction-aware cell...
清华大学的研究团队开发了一种名为SPACE的人工智能算法,能够从单细胞分辨率的空间转录组数据中识别细胞类型和发现组织模块。SPACE在细胞类型识别和组织模块发现方面优于其他工具,并可用于大规模的空间转录组研究。该研究为空间转录组数据分析提供了新的解决方案。