直播预告丨清华大学博士后李雨哲详解 Cell/Nature 子刊论文，探索基因组学的 AI 应用
内容提要
HyperAI超神经将邀请清华大学张强锋实验室博士后李雨哲分享空间转录组学和单细胞组学研究中的AI方法。李雨哲博士的研究成果已发表于Cell Systems，并将进一步介绍该研究中的创新方法。此外，他还参与了基于变分自编码器深度学习框架的人工智能算法SCALEX的研究。活动将分享基因组学研究中的人工智能方法。
延伸解读
从算法到应用：SPACE 与 SCALEX 的定位差异
本次直播涉及的 SPACE 和 SCALEX 分别针对空间转录组和单细胞组学。SPACE 基于图自编码器，学习细胞-细胞相互作用感知的嵌入，用于识别空间细胞类型和发现组织模块；SCALEX 则基于变分自编码器，实现单细胞数据整合。两者均属生成模型框架，但解决的问题不同：前者侧重空间信息表征，后者侧重数据整合。理解这一差异有助于把握 AI 在基因组学中的多样化应用。
SPACE 的核心创新：细胞社区与相互作用感知
SPACE 提出了“细胞社区”概念，即由相似细胞间相互作用网络定义、空间分布均质且边界可辨的组织模块。其模型通过图自编码器框架，将每个细胞的基因表达信息与空间邻近细胞的相互作用信息编码为低维嵌入，再通过聚类识别细胞亚型和组织模块。这种设计使 SPACE 在复杂组织中识别细胞类型和发现组织模块方面优于现有工具，并能优化基于配体-受体的细胞通讯推断。
直播的实用价值：适合哪些观众
直播内容涵盖基因组学中 AI 方法的发展与前沿进展，并具体介绍 SCALEX 和 SPACE 的研究思路。对于希望了解空间转录组和单细胞组学 AI 方法的科研人员、学生或从业者，可以借此初步理解生成模型（如变分自编码器、图自编码器）在生物数据表征中的应用。此外，直播还提供 SPACE 验证所用数据集的下载地址，便于后续复现或深入探索。
Q&A
李雨哲博士将在直播中分享哪些AI方法？
李雨哲博士将在直播中分享空间转录组学和单细胞组学研究中的AI方法，特别是SPACE和SCALEX算法。
SPACE算法的主要功能是什么？
SPACE算法能够识别空间细胞类型并发现组织模块，尤其在复杂组织中表现优于其他工具。
SCALEX算法的研究成果发表在哪个期刊？
SCALEX算法的研究成果已发表在Nature Communications期刊上。
直播活动的时间和主题是什么？
直播活动将于8月21日19:00举行，主题为探索基因组学的AI应用。
SPACE算法是基于什么框架开发的？
SPACE算法是基于图自编码器深度学习框架开发的。
清华大学张强锋实验室的研究方向是什么？
张强锋实验室的研究方向包括结构生物学、基因组学和机器学习等交叉学科领域。
