通过交换计算获得不确定性加速广义线性模型

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内容提要

该研究提出了一种用于基因组关联研究的标准线性模型,具有准确转换、快速算法和有效计算边缘似然的三个创新点。已成功应用于多发性硬化的大规模关联研究。

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关键要点

  • 提出了一种用于基因组关联研究的标准线性模型,包含额外的随机效应。
  • 模型的三个创新点:准确的线性和 log-odds 尺度转换,适用于小效应大小的遗传情况。
  • 开发了一种极大似然算法,速度比以前的方法快一个数量级。
  • 提供了有效的边缘似然计算方法,支持贝叶斯模型比较。
  • 该方法已成功应用于多发性硬化的大规模关联研究,涉及超过20,000个人和500,000个遗传变异。
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