直击三大实体瘤!上海交大团队发布深度学习系统,提高癌症生存预测准确性

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内容提要

世界卫生组织报告显示,非传染性疾病如癌症已成为全球头号杀手。中国国家癌症中心数据显示,2022年中国新发癌症病例约482.47万,死亡病例约257.42万。研究人员开发了深度学习系统,通过病理学图像预测癌症患者的肿瘤微环境信息,实现精确的癌症预后。该系统在结直肠癌、乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌中表现出色。这一研究为癌症预后提供了新的方法和工具。

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延伸解读

技术突破:从基因表达到组织图像的跨越

传统空间转录组学(ST)能精细刻画肿瘤微环境,但成本高、周期长,难以大规模应用。本研究开发的IGI-DL模型,通过分析常规H&E染色组织图像,预测空间基因表达,从而间接描绘肿瘤微环境。这相当于用低成本、易获取的病理图像替代昂贵的ST技术,为在大型队列中开展预后研究提供了新思路。

性能验证:多癌种表现与泛化能力

研究在结直肠癌、乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌三种实体瘤中评估了IGI-DL。与五种现有方法相比,IGI-DL预测空间基因表达的Pearson相关系数平均提升0.171,且在跨平台和跨癌种测试中均保持优势。不过,跨癌种预测性能较单一癌种有所下降,提示肿瘤空间基因表达具有癌种特异性,跨癌种应用仍存挑战。

临床意义:辅助预后与早期风险分层

基于预测的空间基因表达构建的生存模型,在TCGA乳腺癌和结直肠癌队列中C-index分别达到0.747和0.725,优于其他模型。该模型对早期(I-II期)患者同样保持精度,风险评分可作为独立预后指标。在外部测试集MCO-CRC中表现稳定,显示出泛化能力,有望辅助临床决策,避免过度治疗。

定位与局限:AI是助手而非替代

尽管AI在病理图像分析和预后预测中展现出潜力,但研究强调其不能替代病理学专家,而是作为辅助工具提高工作效率。此外,模型依赖高质量的组织学图像和基因表达数据,跨癌种预测性能有限,且尚未在更大规模的前瞻性队列中验证。未来需进一步探索其在数字化生物标志物检测等方向的适用性。

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Q&A

上海交大团队开发的深度学习系统有什么主要功能?

该系统通过组织病理学图像预测癌症患者的肿瘤微环境信息,从而实现精确的癌症预后。

研究中使用了哪些癌症类型的数据进行模型评估?

研究评估了结直肠癌、乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌三种癌症类型的数据。

IGI-DL模型在癌症预后预测中表现如何?

IGI-DL模型在结直肠癌、乳腺癌和皮肤鳞状细胞癌中均表现出色,平均相关系数提升了0.171。

癌症预后分析的重要性是什么?

癌症预后分析有助于提高患者的生存机会,避免过度治疗和医疗资源浪费。

深度学习系统如何处理组织学图像?

系统将H&E染色组织学图像分割成多个非重叠的patches,并利用图神经网络进行分析。

AI在癌症预后分析中的作用是什么?

AI可以辅助病理学专家,提高工作效率,但不能替代专家。

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