PCR计算器
内容提要
“老董工具箱”提供在线PCR计算器,可根据反应总体积、模板DNA浓度与体积、引物工作及储存浓度、Master Mix体积等参数,计算各组分体积和终浓度,并推荐PCR程序。文中还列出标准25 μL体系配方及预变性、变性、退火、延伸等步骤,并简介PCR原理。
延伸解读
参数设置与计算逻辑
计算器需要输入反应总体积、模板DNA浓度与体积、引物工作及储存浓度、Master Mix体积等参数。其中模板DNA浓度用于计算模板体积,引物工作浓度和储存浓度可能用于计算引物稀释或添加量。用户需根据实际实验条件填写,以确保各组分体积和终浓度计算准确。
标准体系与程序参考
文章提供了标准25 μL PCR体系配方,包括2× Master Mix 12.5 μL、正向和反向引物(10 μM)各1.0 μL、模板DNA 1.0-2.0 μL,并用ddH₂O补足。同时给出了标准PCR程序:预变性95°C 3-5分钟,变性95°C 30秒,退火55-65°C 30秒(30-35循环),延伸72°C 1分钟/kb,终延伸72°C 5-10分钟。这些可作为实验起始参考。
使用注意事项
使用计算器时,需注意引物工作浓度与储存浓度的区别,以及Master Mix的浓度(如2×)。模板DNA浓度和体积为可选输入,若填写则用于计算模板体积。计算结果是基于输入参数的推荐值,实际实验可能需要根据酶、引物和模板特性进行优化。
Q&A
PCR计算器能计算哪些参数?
PCR计算器可根据反应总体积、模板DNA浓度与体积、引物工作及储存浓度、Master Mix体积等参数,计算各组分体积和终浓度,并推荐PCR程序。
标准25 μL PCR反应体系如何配制?
标准25 μL PCR体系:2× Master Mix 12.5 μL,正向引物(10 μM) 1.0 μL,反向引物(10 μM) 1.0 μL,模板DNA 1.0-2.0 μL,ddH₂O补至25 μL。
PCR程序中的退火温度和时间是多少?
退火温度为55-65°C,时间30秒,循环30-35次。
PCR的延伸时间如何设置?
延伸温度为72°C,时间按1分钟每kb设置。
PCR的基本原理是什么?
PCR(聚合酶链式反应)是一种体外扩增DNA的技术,通过反复的变性、退火、延伸三个步骤,在短时间内大量扩增特定的DNA片段。
PCR预变性和终延伸的条件是什么?
预变性:95°C,3-5分钟;终延伸:72°C,5-10分钟。