GNN-Suite:用于生物医学信息学的图神经网络基准框架

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内容提要

本研究提出了GNN-Suite,一个用于构建和基准测试图神经网络(GNN)架构的模块化框架,以解决生物医学领域内实验标准化和可重复性的问题。该框架通过系统的评估方法,证明了GNN在识别癌症致病基因方面的优越性,尤其是GCN2模型在结果中表现最佳(平衡准确率0.807),并强调了网络学习相对于单一特征方法的优势。

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