MPI 通信原语及 Python 编程使用
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内容提要
MPI(消息传递接口)是一种用于并行计算的通信协议,广泛应用于科学计算和深度学习。常见实现包括MPICH和OpenMPI,前者适用于标准应用,后者适合高性能网络。MPI支持点对点和集合通信原语,并兼容多种编程语言。运行MPI程序需配置环境和依赖。
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关键要点
- MPI(消息传递接口)是一种用于并行计算的通信协议,广泛应用于科学计算和深度学习。
- MPI有多个实现,常用的有MPICH和OpenMPI,前者适用于标准应用,后者适合高性能网络。
- MPI支持点对点和集合通信原语,兼容多种编程语言。
- 点对点通信包括发送(MPI_Send)和接收(MPI_Recv)数据。
- 集合通信包括屏障(MPI_Barrier)、广播(MPI_Bcast)、分散(MPI_Scatter)、收集(MPI_Gather)、全收集(MPI_Allgather)、归约(MPI_Reduce)和全归约(MPI_Allreduce)。
- 安装MPICH和OpenMPI的命令分别为:apt-get install mpich -y和apt-get install openmpi-bin -y。
- MPI程序的编译命令包括mpicc(C)、mpic++(C++)和mpif77(Fortran)。
- 运行MPI程序的命令包括mpirun和mpiexec。
- 示例代码展示了如何编写MPI Python程序,使用mpi4py库进行数据传输。
- 配置免密登录需要编辑/etc/hosts文件和生成SSH密钥。
- 所有主机应安装相同的MPI实现和版本,并安装mpi4py和numpy依赖。
- 创建Hostfile文件以指定每个主机的最大进程数。
- 运行MPI程序时,可以选择多机多进程或单机多进程的方式。
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