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突破RNA设计瓶颈,上智院联合复旦、上交提出全球首个强化学习与潜扩散融合框架SOLD

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突破RNA设计瓶颈,上智院联合复旦、上交提出全球首个强化学习与潜扩散融合框架SOLD

机器之心
机器之心 · 2026-02-04T06:25:23Z
人工智能如何加速RNA疫苗及其他RNA疗法的开发

麻省理工学院的工程师利用机器学习模型设计纳米颗粒,以更高效地将RNA传递到细胞中。研究团队创建了3000种不同的脂质纳米颗粒(LNP)配方,并通过实验验证了模型的预测能力,显示出新配方的有效性。这种方法有望加速RNA疫苗及治疗代谢疾病的开发。

人工智能如何加速RNA疫苗及其他RNA疗法的开发

MIT News - Artificial intelligence
MIT News - Artificial intelligence · 2025-08-15T09:00:00Z

机器之心数据服务现已上线,提供高效稳定的数据获取服务,帮助用户轻松获取所需数据。

通过对话即可执行DNA、RNA和蛋白质任务,InstaDeep提出多模态智能体ChatNT

机器之心
机器之心 · 2025-06-16T06:03:00Z

该研究探讨了RNA亚细胞定位的预测,提出了利用人工智能和机器学习的新方法,解决了传统方法在时间和资源上的消耗问题。这些新方法能够大规模预测RNA定位,推动RNA研究并为疾病治疗提供指导。

A Comprehensive Review on RNA Subcellular Localization Prediction

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-04-24T00:00:00Z

本研究解决了传统加密系统在后量子时代面临的脆弱性问题,提出了一种新的生物融合加密框架crypto-ncRNA,该框架利用非编码RNA的动态折叠特性生成高熵、抗量子攻击的密钥,并生成不可预测的密文。实验显示,尽管crypto-ncRNA的加密速度略低于AES,但在效率和可扩展性上显著优于RSA,并在NIST SP 800-22随机性测试中取得100%的通过率,展示了其在保护数字基础设施方面的潜力和高效性。

基于非编码RNA的加密算法Crypto-ncRNA

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-04-24T00:00:00Z

新加坡国立大学的张阳教授团队开发了深度学习框架DRfold2,显著提升了非编码RNA的三维结构预测精度,超越现有方法,为RNA结构解析提供了新计算手段,推动了分子生物学的发展。

新加坡国立大学张阳团队开发第二代RNA结构预测算法,多项基准测试超越SOTA

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-03-27T10:54:14Z
分子对接速度提升10,000倍,深度图学习加速RNA虚拟筛选,助力药物靶标发现

麦吉尔大学等机构开发的RNAmigos2是一种基于结构的RNA虚拟筛选方法,其速度比传统对接快一万倍,能够有效筛选化合物。这一方法在RNA药物发现中尤为重要,特别是针对ncRNA和肿瘤靶点,研究成果已公开,推动了RNA药物的开发。

分子对接速度提升10,000倍,深度图学习加速RNA虚拟筛选,助力药物靶标发现

机器之心
机器之心 · 2025-03-25T04:01:27Z
剑桥团队革新RNA速率分析:AI算法突破基因动态追踪

cell2fate是一种新的RNA速率分析贝叶斯模型,通过剪接和未剪接RNA计数推断转录动力学。该模型线性化复杂微分方程,提供更准确的生物物理模型,增强细胞命运预测能力。研究表明,cell2fate在多个数据集中表现优异,能够捕捉细胞轨迹和动态过程。

剑桥团队革新RNA速率分析:AI算法突破基因动态追踪

机器之心
机器之心 · 2025-03-20T06:12:57Z

阿尔茨海默病等神经退行性疾病与蛋白质-RNA结合异常有关。研究者提出CoPRA模型,通过结合蛋白质和RNA的语言模型,预测结合亲和力,取得了优异的性能,推动了生物医学研究的进展。

入选AAAI 2025!清华/伦敦大学学院等首创蛋白质-RNA语言模型融合方案,结合亲和力预测刷新SOTA

HyperAI超神经
HyperAI超神经 · 2025-03-13T08:10:55Z
融合图神经网络与无监督语言模型,对RNA-蛋白质相互作用精准预测

华中师范大学与美国华盛顿大学和达特茅斯学院合作推出ZHMolGraph模型,结合图神经网络与无监督语言模型,显著提升RNA-蛋白质相互作用预测的准确性。该模型在基准数据集上取得79.8%的AUROC和82.0%的AUPRC,成为全基因组RNA-蛋白质预测的可靠工具。

融合图神经网络与无监督语言模型,对RNA-蛋白质相互作用精准预测

机器之心
机器之心 · 2025-03-10T09:09:00Z

本研究提出了一种新的潜在编码scDD框架,旨在解决单细胞RNA测序数据的高维稀疏性和批次效应问题。该方法通过压缩基础模型知识和原始数据,生成合成的scRNA-seq数据集,显著提升数据分析性能,绝对提高7.61%,相对提升15.70%。

Latent Code-Based Distillation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data with Foundation Model Knowledge

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-03-06T00:00:00Z

本研究解决了RNA分子设计中与特定蛋白质相互作用的挑战,提出了一种深度学习模型RNA-BAnG,能够在没有大量实验确定的RNA序列或对RNA结构深入了解的情况下生成RNA序列。通过双向锚定生成的创新方法,该模型显示出在生物序列的条件RNA序列设计中的有效性,具有显著的潜在影响。

双向锚定生成的条件RNA设计

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-02-28T00:00:00Z

聚合酶是一种催化DNA或RNA聚合的酶,利用现有的RNA或DNA链作为模板。术语“in silico”指计算机模拟,“in vitro”指试管实验,而“in vivo”则指活体实验。

术语表

shrik3
shrik3 · 2025-02-27T22:00:15Z
一种古老的RNA引导系统可能简化基因编辑疗法的递送

麻省理工学院的研究人员开发了一种新型基因编辑工具TIGR系统,利用RNA引导至特定DNA位点。与CRISPR相比,TIGR系统更紧凑灵活,能够针对任意DNA序列,且不受短序列限制。这一发现为基因编辑开辟了新方向,研究团队正在探讨其在病毒中的自然角色及治疗应用。

一种古老的RNA引导系统可能简化基因编辑疗法的递送

MIT News - Artificial intelligence
MIT News - Artificial intelligence · 2025-02-27T22:00:00Z
预测所有物种DNA、RNA、蛋白质的形式和功能,Arc、斯坦福、NVIDIA发布最大AI生物模型Evo2

科学家们发布了有史以来最大的生物人工智能模型Evo-2,该模型基于128,000个基因组进行训练,能够编写染色体并理解复杂的DNA变体。Evo-2由Arc研究所、斯坦福大学和NVIDIA共同开发,旨在帮助科研人员解读基因组特征并推动基因组设计的进步。

预测所有物种DNA、RNA、蛋白质的形式和功能,Arc、斯坦福、NVIDIA发布最大AI生物模型Evo2

机器之心
机器之心 · 2025-02-20T06:57:00Z

本研究提出了Life-Code框架,整合多组学数据,解决了现代生物预训练模型在分析DNA、RNA和蛋白质相互作用时的不足。该框架通过逆转录和逆翻译过程,实现了对复杂基因序列的全面理解,实验结果显示其在多项任务上表现优异,展现了在多组学分析中的潜力。

Life-Code: Central Dogma Modeling Based on Multi-Omics Sequence Unification

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-02-11T00:00:00Z

该研究提出了一种新颖的图神经网络模型,旨在提升单细胞RNA测序在肿瘤微环境中对细胞异质性的研究。该模型显著提高了细胞类型预测和细胞间相互作用分析的准确性,平均准确率达到84.83%。

Graph Structure Learning in Tumor Microenvironment: Cell Type Annotation Based on Non-Spatial Single-Cell RNA Sequencing Data

BriefGPT - AI 论文速递
BriefGPT - AI 论文速递 · 2025-02-04T00:00:00Z
实现5Å全原子RMSD,普渡大学深度学习方法准确预测RNA三级结构,登Nature子刊

普渡大学研究人员开发了NuFold,一种基于深度神经网络的RNA三级结构预测方法。该方法通过端到端训练,利用灵活的核碱基中心表示法,准确预测RNA结构,克服了RNA结构数据不足的挑战,并在局部几何结构和RNA多聚体复合结构的预测上表现优异。

实现5Å全原子RMSD,普渡大学深度学习方法准确预测RNA三级结构,登Nature子刊

机器之心
机器之心 · 2025-01-28T08:04:00Z

国内首个国产版AlphaFold3——HelixFold3发布,精准度超越AlphaFold3,支持在线服务,零代码操作,推理成本低,速度快。该模型在RNA和抗原-抗体结构预测中表现优异,助力药物研发,降低科研成本。

首个国产版AlphaFold3发布!大分子预测精度超车,在线平台即开即用,推理成本更是白菜价

量子位
量子位 · 2025-01-17T03:47:29Z

本研究分析了新辅助mFOLFOX6化疗在局部晚期直肠癌患者中的疗效,结果显示其与传统治疗方案在长期生存率上无显著差异。同时,CLEAR试验表明Lenvatinib与Pembrolizumab联合治疗晚期肾细胞癌的效果优于Sunitinib。研究强调了亚组分析的重要性,揭示了不同治疗方案的预后因素。

前沿快讯 第66期 通过单个RNA分子的AFM图像确定其三维拓扑结构等

浮云翩迁之间
浮云翩迁之间 · 2024-12-28T13:09:27Z
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