继 Evo 2 之后,Arc Institute 发布首个虚拟细胞模型 STATE,训练数据涉及 70 种不同细胞系

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内容提要

研究人员开发了虚拟细胞模型STATE,能够预测细胞在药物干预下的反应,从而提高药物研发效率。该模型基于1.67亿个细胞观察数据和1亿个干预数据,优于现有方法,支持零样本预测,推动精准医学的发展。

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关键要点

  • 研究人员开发了虚拟细胞模型STATE,能够预测细胞在药物干预下的反应。
  • STATE模型基于1.67亿个细胞观察数据和1亿个干预数据,优于现有方法。
  • 该模型支持零样本预测,推动精准医学的发展。
  • STATE模型由STATE Transition(ST)和STATE Embedding(SE)两大核心模块组成。
  • ST模型通过自注意力机制建模干预在细胞集合中的转化过程。
  • SE模型旨在学习细胞嵌入,优化捕捉细胞类型特异性的基因表达模式。
  • STATE在多个评测任务上表现优于现有基线模型,尤其在基因表达计数和差异表达基因的预测上。
  • STATE模型支持零样本预测,能够在未见过的细胞环境中准确预测干预效应。
  • Arc Institute是一个专注于生命科学前沿研究的非营利性科研机构,成立于2021年。
  • Arc Institute推出了一系列重磅成果,包括虚拟细胞图谱和基于DNA的大规模训练模型Evo。
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