Jiayi Liu
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从单细胞RNA测序数据推断系统发育
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原文英文，约200词，阅读约需1分钟。
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内容提要
肿瘤由不同遗传特征和表型的癌细胞亚群组成，重建肿瘤进化过程可以了解驱动肿瘤进展的特性获取。PhylinSic是一种从单细胞RNA测序数据中重建细胞基因表达谱与进化关系的方法。该方法能够识别与药物选择和转移相关的进化关系，并且足够敏感以识别基因漂移的亚克隆。对化疗耐药的乳腺癌肿瘤中存在多个独立获得高K-Ras和β-catenin的遗传谱系。PhylinSic可以使用单细胞RNA测序重建肿瘤的进化并将细胞的基因型和表型联系起来。
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关键要点
- 肿瘤由不同遗传特征和表型的癌细胞亚群组成，随着时间和治疗而进化。
- 重建肿瘤进化过程有助于理解驱动肿瘤进展的恶性特性获取。
- PhylinSic是一种从单细胞RNA测序数据中重建细胞基因表达谱与进化关系的方法。
- 该方法使用概率平滑方法调用核苷酸，并通过贝叶斯建模算法估计进化树。
- PhylinSic能够识别与药物选择和转移相关的进化关系，并能识别基因漂移的亚克隆。
- 化疗耐药的乳腺癌肿瘤中存在多个独立获得高K-Ras和β-catenin的遗传谱系。
- PhylinSic可以重建肿瘤的进化，并将细胞的基因型和表型联系起来。
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