CHOTA:一种更高阶准确性的细胞追踪评估指标
原文中文,约300字,阅读约需1分钟。发表于: 。该研究解决了当前细胞追踪评估指标在全局一致性方面的不足。提出的CHOTA指标通过对细胞轨迹的重新定义,统一了细胞检测、局部关联、全局一致性和谱系追踪的评估。研究表明,CHOTA更敏感于各种追踪错误,提供了对细胞全谱系重建能力的良好指示,有望促进生物医学研究中的细胞追踪方法发展。
该研究提出了一种通过分割选择方法实现大规模三维细胞追踪的方法,解决了显微数据集中的细胞追踪问题。该方法通过层次结构计算细胞轨迹和分割,并通过最大化相邻帧之间的重叠来选择不相交的分割。该方法在细胞追踪挑战中取得了最先进的结果,并具有更快的整数线性规划公式。