文心生物计算大模型重磅升级,构象预测准确度全面提升!

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内容提要

百度飞桨螺旋桨团队推出了蛋白质-小分子对接构象预测模型HelixDock和蛋白-蛋白复合物结构预测模型HelixFold-Multimer,提高了蛋白质-小分子对接构象和蛋白-蛋白复合物结构预测的准确性,为基于结构的药物设计提供了基础。HelixDock在对比其他方法时表现出色,HelixFold-Multimer在抗原-抗体和多肽-蛋白复合物的预测中也取得了突破进展。

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关键要点

  • 百度飞桨螺旋桨团队推出了HelixDock和HelixFold-Multimer模型,提升了蛋白质-小分子对接和蛋白-蛋白复合物结构预测的准确性。
  • HelixDock模型通过大规模模拟数据集和几何神经网络的升级,显著提高了对接构象预测的准确度。
  • 在PDBBind核心集上,HelixDock的RMSD≤2Å的比例高达89%,在Recent-PDB和PoseBusters基准集上也表现优异。
  • HelixFold-Multimer模型在抗原-抗体和多肽-蛋白复合物的结构预测中取得了突破,DockQ值显著提升。
  • HelixFold-Multimer在Sabdab抗原-抗体测试数据上,单模型DockQ达到0.49,多模型融合DockQ达到0.5,成功率为67.6%。
  • 在多肽-蛋白复合物结构预测中,HelixFold-Multimer的单模型DockQ达到0.380,多模型融合DockQ达到0.387,领先于其他方法。
  • 团队计划近期向公众开放HelixDock和HelixFold-Multimer的试用,并希望与科研工作者合作推动生物计算领域的技术变革。
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