单细胞分析 marker 基因数据库

单细胞分析 marker 基因数据库

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内容提要

本文介绍了几个主流的细胞marker数据库,包括CellMarker、PanglaoDB、BD Life Sciences CD Marker Chart、Mouse Cell Atlas、PlantCellMarker和CellKb。这些数据库收集了人类和小鼠各组织器官的经典标志物,并提供了自动注释、人工注释和验证等功能。其中,CellMarker的检索交互最舒服,PanglaoDB的UI与可信度相关,BD Life Sciences CD Marker Chart总结了人类和小鼠的经典Marker,Mouse Cell Atlas是小鼠数据库,PlantCellMarker收集了6种植物的数据,而CellKb是一个付费的单细胞注释辅助工具。

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